No se refrenta con el "charriot" sino con el carro transversal , pero como la foto es algo "confusa" porque no veo que tenga carro transversal "operativo" .
Si solo esta operativo el charriot , un reloj comparador te ayudara a ponerlo a 90° respecto de la bancada.
O refrentando una pieza de sacrificio e ir midiendo con una regla , apoyandola en la pieza refrentada hasta que esta apoye en toda la superfie , cuando eso ocurre tienes "tus 90°" y solo te queda hacer una marca para en el futuro tener referencia.
Todo eso presuponiendo que el cabezal esta alineado correctamente.
Saludos.